طالبان افغانستان فعالیت دفاتر کمیته امداد امام خمینی(ره) در شهرهای کابل، مزار شریف و هرات را متوقف کرده است. یک منبع محلی با تایید این خبر در گفت و گو با جماران می گوید که این دفترها به دستور نیروهای طالبان پلمپ شده اند. به گفته او، فعالیت نمایندگی کمیته امداد در کابل قریب به یک ماه پیش و نمایندگی های مزار و هرات روز نهم مردادماه به دستور طالبان متوقف شده است. گفته می شود که نیروهای طالبان به نمایندگی کمیته امداد در شهر زرنج (مرکز ولایت نیمروز) که شهر مرزی با ایران است نیز مراجعه کرده اند اما ظواهر امر حاکی از این است که فعالیت این دفتر همچنان ادامه دارد.
چند فرد مطلع در پاسخ به درباره چرایی دستور جدید طالبان برای توقف فعالیت‌های دفاتر کمیته امداد امام خمینی در افغانستان اعلام کردند که این اقدام بدون اطلاع قبلی و‌ بدون ارائه هیچ دلیل موجه و یا استناد حقوقی انجام شده است.
کمیته امداد در افغانستان از وزارت مربوطه (‌کار) مجوز  داشته و به وزارت اقتصاد هم مالیات پرداخت می کرده است. برخورد طالبان با دفاتر کمیته امداد در افغانستان در حالی صورت گرفته که منابع محلی در گفت و گو با جماران تایید کردند که طالبان تا کنون برای فعالیت دفاتر خارجی با مسئولیت و ماموریت مشابه مانند تیکا از ترکیه،  save the children از انگلیس،  Giz از آلمان،  ACTED از کانادا و … محدودیتی قائل نشده اند.
به نظر می‌رسید که طالبان پس از بازگشت به قدرت با ادامه فعالیت‌های کمیته امداد در کمک‌رسانی به مردم افغانستان مخالفت علنی و مشخصی نداشته باشند چنانچه  مولوی مخدوم عبدالسلام معاون وزیر کار و امور اجتماعی طالبان در اردیبهشت ماه 1401 در دیدار با لکزائی فرد،  رئیس دفتر نمایندگی کمیته امداد امام خمینی(ره) در افغانستان  ضمن قدردانی از فعالیت و کارکرد موثر کمیته امداد امام خمینی(ره) در افغانستان خواستار همکاری‌ بیشتر این نهاد در  آموزش فنی و حرفه‌ای و کار آفرینی در این کشور شده بود.
در همین رابطه، فاطمه اشرفی، رییس هیات امنای انجمن حامی درباره فعالیت های کمیته امداد در افغانستان به جماران می گوید: «کمیته امداد امام در افغانستان یکی از قدیمی ترین و موثرترین نهادهای حمایتی و امداد رسان بوده است که حتی در دوران حاکمیت طالبان هم بی وقفه و بدون هر گونه ملاحظه سیاسی به امر حمایت از گروه‌های بی شمار زنان سرپرست خانوار، ایتام، ابن سبیل و معلولان  می‌پرداخت. این حمایت‌ها و فعالیت‌های امدادی در ۱۸ سال گذشته هم ادامه داشته و حتی بخش قابل توجهی از فعالیت‌ها به اقدامات توانمند‌سازی و کارآفرینی اختصاص پیدا کرده بود و دوره های آموزشی متعددی برای گروه‌های اجتماعی مختلف برگزار می شد. دوره‌های آموزشی شغلی که نقش بسزایی  در  توانمندسازی اقتصادی و خودکفایی فردی و خانوادگی گروه‌های فرودست ایفا می‌کرد.»
اشرفی با اشاره به محدودیت هایی که طالبان از زمان بازگشت به قدرت بر جامعه افغانستان به‌خصوص زنان تحمیل کردند می‌گوید: «طالبان از ماه های گذشته اجازه برگزاری دوره های آموزشی مختلف برای زنان و دختران را لغو کردند و در روزهای اخیر کل خدمات دفاتر امداد در افغانستان از سوی طالبان متوقف شد بدون در نظر گرفتن اینکه اکثریت افراد تحت پوشش، مراکز امداد برایشان آخرین دریچه های امیدی بوده است که درصورت عدم دریافت حمایت‌ها، ادامه حیات و زندگی شرافتمندانه برایشان امکان پذیر نیست. نکته قابل توجه دیگر اینکه یکی از مهم ترین گروه‌های تحت حمایت دفاتر امداد امام، زنان ایرانی مزدوج با مردان افغان بوده‌اند که متاسفانه از فقیرترین و آسیب‌پذیرترین گروه‌های اجتماعی در افغانستان هستند که بعضا وضعیت زندگی آنها از گروه‌های مستمند افغان نیز ضعیف‌تر است. کمیته امداد مرجع حمایتی این گروه از زنان ایرانی و خانواده هایشان هم بوده است که با وضعیت ایجاد شده، نمی‌دانم تکلیف این زنان چه می شود.»
یک منبع سیاسی مطلع در کابل درباره چرایی برخورد جدید طالبان با فعالیت کمیته امداد این برخورد را در ادامه سیاستهای محدودیت زای طالبان علیه ایران و تمدن ایرانی، فارسی زدایی، مقابله با شیعیان قابل توجیه می‌داند.